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Biblioteca(s):  Embrapa Café.
Data corrente:  08/01/2018
Data da última atualização:  10/01/2018
Tipo da produção científica:  Resumo em Anais de Congresso
Autoria:  CARNEIRO, F. de A.; MARRACCINI, P.; SILVA JUNIOR, O. B. da; GRATTAPAGLIA, D.; ANDRADE, A. C.
Afiliação:  Fernanda de Araújo Carneiro, Universidade Federal de Lavras; Pierre Marraccini, Cirad, UMR, DAP; ORZENIL BONFIM DA SILVA JUNIOR, Cenargen; DARIO GRATTAPAGLIA, Cenargen; ALAN CARVALHO ANDRADE, SAPC.
Título:  Development and validation of a 26K Axiom® SNP array for Coffea canephora.
Ano de publicação:  2017
Fonte/Imprenta:  In: SIMPÓSIO INTERNACIONAL DE GENÉTICA E MELHORAMENTO, 8., 2017, Viçosa, MG. Ômicas: do gene ao fenótipo. [Proceedings...] Viçosa, MG: UFV, 2017.
Idioma:  Inglês
Conteúdo:  World coffee production is higly affected by climate changes due to the occurrence of severe droughts and high temperatures resulting in low flow er viability, fruit development and yield. Faster breeding methods are required to obtain adapted coffee plants to a changed climate cenario, as conventional breeding in perennial crops such as coffee, requires a long time. With the recent advances in coffee genomics, such as the availability of a C. canephora reference genome , the objective of this work was to develop and validate a 26K Axiom SNP array for C. canephora aiming at a reliable high throughput genotyping platform to be used in the breeding programmes of the species. The chip design was based on a whole - genome resequencing panel comprised by DNA pools of C. canephora Conilon and pools formed by individuals representing the different genetic diversity groups of C. canephora.
Palavras-Chave:  Coffe canephora Conilon; Coffee genomics; Coffee plant; Genetic diversity; Genomic selection.
Thesagro:  Coffea Canephora.
Thesaurus Nal:  Climate change.
Categoria do assunto:  --
URL:  https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/170574/1/Development-and-validation-of-a-26K-Axiom-SNP-array-for-Coffea-canephora.pdf
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Café (CNPCa)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status URL
CNPCa - SAPC1255 - 1UPCRA - DD
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1.Imagem marcado/desmarcadoSILVA JUNIOR, O. B. da. Development and applications of high-throughput SNP genotyping technologies in non-model plant genomes. 2017 169 f. Tese (Doutorado em Ciências Genômicas) - Universidade Católica de Brasília, Brasília, DF. Orientador: Dário Grattapaglia, Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
Tipo: Orientação de Tese de Pós-Graduação
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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2.Imagem marcado/desmarcadoSILVA JUNIOR, O. B. da; GRATTAPAGLIA, D. Genome-wide patterns of recombination, linkage disequilibrium and nucleotide diversity from pooled resequencing and single nucleotide polymorphism genotyping unlock the evolutionary history of Eucalyptus grandis. New Phytologist, v. 208, p. 830-845, 2015.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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3.Imagem marcado/desmarcadoSILVA JUNIOR, O. B. da; FARIA, D. A.; GRATTAPAGLIA, D. A flexible multi-species genome-wide 60K SNP chip developed from pooled resequencing of 240 Eucalyptus tree genomes across 12 species. New Phytologist, v. 206, n. 4, p. 1527(14), 2015.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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4.Imagem marcado/desmarcadoGRATTAPAGLIA, D.; SILVA JUNIOR, O. B. da; RESENDE, L. V.; SILVA, P. I. T. A five-species 50K Axiom SNP microarray allows high quality genotyping of coffee, cashew, cassava, brazilian pine and eucalyptus. In: PLANT AND ANIMAL GENOME CONFERENCE, 25., 2017, San Diego. [Abstracts...]. San Diego, CA: [s.n.], 2017.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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5.Imagem marcado/desmarcadoCARNEIRO, F. de A.; MARRACCINI, P.; SILVA JUNIOR, O. B. da; GRATTAPAGLIA, D.; ANDRADE, A. C. Development and validation of a 26K Axiom® SNP array for Coffea canephora. In: SIMPÓSIO INTERNACIONAL DE GENÉTICA E MELHORAMENTO, 8., 2017, Viçosa, MG. Ômicas: do gene ao fenótipo. [Proceedings...] Viçosa, MG: UFV, 2017.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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6.Imagem marcado/desmarcadoCARNEIRO, F. de A.; MARRACCINI, P.; SILVA JUNIOR, O. B. da; GRATTAPAGLIA, D.; ANDRADE, A. C. Development and validation of a 26K Axiom® SNP array for Coffea canephora. In: SIMPÓSIO INTERNACIONAL DE GENÉTICA E MELHORAMENTO, 8., 2017, Viçosa, MG. Ômicas: do gene ao fenótipo. [Proceedings...] Viçosa, MG: UFV, 2017.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Café.
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7.Imagem marcado/desmarcadoSILVA JUNIOR, O. B. da; GRATTAPAGLIA, D.; NOVAES, E.; COLLEVATTI, R. G. Design and evaluation of a sequence capture systemfor genome-wide SNP genotyping in highly heterozygous plant genomes: a case studywith a keystone Neotropical hardwood tree genome. DNA Research, v. 25, n. 5, p. 535-545, 2018. Na publicação: Orzenil Bonfim Silva-Junior.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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8.Imagem marcado/desmarcadoRESENDE, L. V.; SOUSA, V. A. de; SILVA JUNIOR, O. B. da; GRATTAPAGLIA, D. Desenvolvimento de novos microssatélites em Araucaria angustifolia via redução de complexidade genômica e sequenciamento. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 3., 2014, Santos. Anais... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2014. CD-ROM. Resumo.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Florestas; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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9.Imagem marcado/desmarcadoCARNEIRO, F. de A.; MARRACCINI, P.; SILVA JUNIOR, O. B. da; GRATTAPAGLIA, D.; ANDRADE, A. C. Desenvolvimento e validação do chip de genotipagem 26K Axiom® SNP array em Coffea canephora. In: CONGRESSO DA PÓS-GRADUAÇÃO DA UFLA, 26., 2017, Lavras. Anais... Lavras: UFLA, 2017.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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10.Imagem marcado/desmarcadoCARNEIRO, F. de A.; MARRACCINI, P.; SILVA JUNIOR, O. B. da; GRATTAPAGLIA, D.; ANDRADE, A. C. Desenvolvimento e validação do chip de genotipagem 26K Axiom® SNP array em Coffea canephora. In: CONGRESSO DA PÓS-GRADUAÇÃO DA UFLA, 26., 2017, Lavras. Anais... Lavras: UFLA, 2017.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Café.
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11.Imagem marcado/desmarcadoTANNO, P.; SILVA JUNIOR, O. B. da; RESENDE, L. V.; SOUSA, V. A. de; GRATTAPAGLIA, D. A genotyping array of 3,400 Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) advances the genetic analysis of the iconic tree Araucaria angustifolia, showing that the natural populations ar e more differentiated than previously reported. Pesquisa Florestal Brasileira, Colombo, v. 39, (nesp), e201902043, 2019. p. 188. Edição especial dos resumos do IUFRO World Congress, 25., 2019, Curitiba.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Florestas.
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12.Imagem marcado/desmarcadoANDRADE, A. C.; SILVA JUNIOR, O. B. da; CARNEIRO, F.; MARRACCINI, P.; GRATTAPAGLIA, D. Towards GWAS and Genomic Prediction in Coffee: Development and Validation of a 26K SNP Chip for Coffea Canephora. In: PLANT & ANIMAL GENOME, 25., 2017, San Diego. Final program & exhibite guide... San Diego: USDA, 2017.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Café; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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13.Imagem marcado/desmarcadoALVES, W. B. dos S.; PACHECO, C. A. P.; SILVA JUNIOR, O. B. da; GRATTAPAGLIA, D. High density genetic mapping of dwarfism traits ina a tall x dwarf coconut (Cococs nucifera L.) F2 population uncovers a major QTL for early flowering col-localized with the flowering time gene FT. In: BRAZILIAN CONGRESS OF GENETICS, 68., 2023, Ouro Preto. Paleogenomics: sequencing ancient DNA. E-book. Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2023. p. 425.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros.
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14.Imagem marcado/desmarcadoALVES, W. B. dos S.; PACHECO, C. A. P.; SILVA JUNIOR, O. B. da; GRATTAPAGLIA, D. High density genetic mapping of dwarfism traits in a tall x dwarf coconut (Cocos Nucifera L.) f2 population uncovers a major QTL for early flowering co-localized with the flowering time gene FT. In: BRAZILIAN CONGRESS OF GENETICS, 68., 2023, Ouro Preto. Paleogenomics: sequencing ancient DNA. E-book. Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2023. p. 425
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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15.Imagem marcado/desmarcadoTELFER, E. J.; STOVOLD, G. T.; LI, Y.; SILVA JUNIOR, O. B. da; GRATTAPAGLIA, D.; DUNGEY, H. S. Parentage reconstruction in eucalyptus nitens using SNPs and microsatellite markers: a comparative analysis of marker data power and robustness. Plos One, July 9, 2015. (Open Access)
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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16.Imagem marcado/desmarcadoBARROS, L. M. G.; SILVA JUNIOR, O. B. da; GARCIA, R. A.; ANDRADE, L. R. M. de. Metodologia para análise de transcritoma de pontas de raÍzes de árvore tropical por RNA-Seq. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 2., 2012, Belém, PA. Anais... [S.l.]: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2012. 1 CD-ROM.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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17.Imagem marcado/desmarcadoBARBOSA, T.; FALEIRO, F. G.; JUNQUEIRA, N. T. V.; OLIVEIRA, J. da S.; SILVA JUNIOR, O. B. da; GRATTAPAGLIA, D. Caracterização e diversidade genética de híbridos e genitores de Passiflora edulis Sims com base em marcadores SNPs. Revista MT Horticultura, v. 9, n. 1, p. 20, 2023. Na publicação: Orzenil Bonfim Silva Júnior. Apresentado no VIII Simpósio Brasileiro da Cultura do Maracujazeiro, Tangará da Serra, MT.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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18.Imagem marcado/desmarcadoBARBOSA, T.; FALEIRO, F. G.; JUNQUEIRA, N. T. V.; OLIVEIRA, J. da S.; SILVA JUNIOR, O. B. da; GRATTAPAGLIA, D. Caracterização e diversidade genética de híbridos e genitores de Passiflora edulis Sims com base em marcadores SNPs. Revista MT Horticultura, v. 9, n. 1, p. 20, 2023. Na publicação: Orzenil Bonfim Silva Júnior. Apresentado no VIII Simpósio Brasileiro da Cultura do Maracujazeiro, Tangará da Serra, MT.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Cerrados.
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19.Imagem marcado/desmarcadoSANTOS, C. A. F.; COSTA, S. R. da; BOITEUX, L. S.; GRATTAPAGLIA, D.; SILVA JUNIOR, O. B. da. Genetic associations with resistance to Meloidogyne enterolobii in guava (Psidium sp.) using cross-genera SNPs and comparative genomics to Eucalyptus highlight evolutionary conservation across the Myrtaceae. PLoS ONE, v. 17, n. 11, e0273959, 2022.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia; Embrapa Semiárido.
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20.Imagem marcado/desmarcadoCOLLEVATTI, R. G.; NOVAES, E.; SILVA JUNIOR, O. B. da; VIEIRA, L. D.; LIMA-RIBEIRO, M. S.; GRATTAPAGLIA, D. A genome-wide scan shows evidence for local adaptation in a widespread keystone Neotropical forest tree. Heredity, v. 123, p. 117-137, 2019. Na publicação: Orzenil B. Silva-Junior.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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